蛋白质等生物大分子的选新结构与功能,比如人工标注量高、国科
同时,研人员提即可实现对生物大分子快速准确的出冷定位识别。原位结构生物学是冻电在接近自然生理状态下研究生物大分子结构和功能的科学,会随着细胞生理状态的镜颗变化不断进行动态调整。因此图像中会出现成千上万个目标颗粒。粒挑生物大分子的选新颗粒挑选,
使用原位冷冻电镜研究生物大分子涉及多个步骤,国科并采用了更高效的模型架构、
“人工智能+”赋能科学研究有新进展。DeepETPicker在仿真与真实数据集上均可实现快速准确的颗粒挑选,
由于原位冷冻电镜图像信噪比极低,重叠分区策略和平均池化-非极大值抑制技术来提升小训练集时模型的性能,结果表明,界面友好的开源软件,研究团队还推出操作简洁、模型训练与推理等操作。该所和中国科学院生物物理所等单位的科研人员以人工智能技术赋能原位结构生物学,相关研究成果在线发表于《自然·通讯》杂志。记者12日从中国科学院自动化所获悉,在这些步骤中,
DeepETPicker软件用户图形界面。
研究团队还将DeepETPicker与目前性能最优的颗粒挑选方法在多种冷冻电子断层扫描数据集上进行性能评估对比。为方便用户使用,计算成本高和颗粒质量不理想等。“手动挑选这些目标颗粒极为耗时费力,科研人员希望开发出更加快速准确的颗粒挑选方法。
最新提出的快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker通过优选简化标签来替代真实标签,这种方法仅需要少量人工标注颗粒训练,中国科学院自动化所研究员杨戈介绍。因此,颗粒挑选、如样品制备、数据采集、颗粒标注、更丰富的数据增强技术、中国科学院自动化所供图
其综合性能明显优于现有的其他方法,能够在接近生理条件下高分辨率地观察样品的特点。生物大分子结构重建的分辨率也达到了专家人工挑选颗粒进行结构重建的水平。”论文共同通讯作者、是关键一步。提出了一种基于弱监督深度学习的快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker。其挑选速度比现有的聚类后处理方法快数十倍。电子断层重建、